卓溪鄉文旦以「立山文旦」聞名，產自海拔較高、有清澈泉水灌溉的地區，具有果肉細嫩、多汁、酸甜適中的特色，與玉里、瑞穗等地的文旦一同構成了花蓮東部高品質文旦的重要產區，是「玉溪文旦」品牌的一部分。
立山文旦是產自花蓮卓溪鄉立山村的特色文旦，因生長在秀姑巒溪畔的優良環境，擁有清甜多汁、果肉細緻、香氣濃郁的特色，以其獨特風味和高品質，與台南麻豆文旦齊名，成為中秋節應景水果的優質選擇。
花蓮卓溪鄉咖啡以高海拔、純淨環境著稱，擁有強烈日夜溫差、無汙染水源，適合栽種具花果香、茶感的特色咖啡。
花蓮卓溪鄉以栽種高品質的「夏雪芒果」和「蜜雪芒果」聞名，這些芒果香氣濃郁、甜度高，是愛文芒果的後代，由當地政府與農會大力行銷，常舉辦「卓溪好芒」活動，推出特色芒果產品，吸引消費者支持，是夏季不可錯過的花蓮在地美味。
花蓮縣卓溪鄉有種植黃金果，鄉親們擁有超過10年的種植經驗，並以友善種植的方式生產出高品質的果實。
卓溪鄉的黃金果受益於花蓮的好山好水，其果實品質優良，質量佳。
花蓮卓溪鄉是花東縱谷重要的水稻產區之一，以其得天獨厚的自然環境和優質水源，種植出米粒飽滿、口感極佳的稻米，其中以南安部落的水稻田聞名，吸引許多人投入有機耕作，並有「玉山腳下第一畝田」的美譽，產出如台稉2號、4號等優良品種，是台灣東部優質米的代表。
黃金苦茶油：苦茶樹過去叫做天綠果，在種植四年後即開花結實，並可維持50年採果而不衰。其種子含油量25~30%，食用之苦茶油含豐富的蛋白質及山茶。山茶具有防癌功能，加上苦茶油對高溫的安定性佳，是相當高級的食用植物油，品質同等於橄欖油，是卓溪鄉重要的農業資產，也將是台灣發展精緻農業最看好的農特產品之一。
